随着分子遗传学和分子生物技术的发展，大量DNA水平上的分子标记及其检测技术随之出现，并广泛应用于图谱构建、遗传多样性研究、品种鉴别、基因定位、基因克隆、分子标记辅助选择和育种，取得了骄人的成绩。基于作者近年来在分子标记领域取得的研究成果，并参考了国内外相关领域的最新进展，编著了《水稻DNA指纹及应用》。《水稻DNA指纹及应用》详细了介绍了DNA指纹的发展、种类和应用。
第一章 DNA指纹图谱概述
第一节 DNA指纹图谱的产生
一 可变重复序列的发现
二 DNA指纹图谱的建立
第二节 DNA指纹图谱的发展
一 形态学标记（Mollahological matkers）
二 细胞学标记（Cytological markers）
三 生化标记（Biochemical markers）
四 DNA分子标记（Molecular markers）
第三节 DNA指纹图谱的特点
一 DNA指纹图谱的基本特点
二 DNA分子标记的优点
三 DNA分子标记的要求
第四节 DNA指纹图谱应用
一 法医学
二 动植物科学
三 流行病学
第二章 DNA指纹技术类型
第一节 DNA指纹技术分类
一 根据检测手段及相关技术分类
二 根据DNA指纹技术的发展分类
第二节 常见的DNA指纹技术
一 限制性片段长度多态性（Restriction fragment length polymorophism，RFLP）
二 单链构象多态性（Single strand conformation polymorphism，SSCP）
三 变性梯度凝胶电泳（Denaturing gradient gel electrophoresis，DGGE）
四 原位杂交（in situ Hybridation，ISH）
五 序列标记位点（Sequence—tagged site，STS）
六 随机扩增多态性DNA（Random amplified polymorphic DNA，RAPD）
七 序列特征化扩增区域（Sequence charactered amplified region，SCAR）技术
八 随即引物PCR（Random primer PCR．RP-PCR）
九 DNA扩增指纹技术（DNA amplification finger-printing，DAF）
十 扩增的限制性内切酶片段长度多态性（Amplified fragment length polymorphism，AFLP）
十一 简单序列重复（Simple sequence repeat，SSR）
十二 简单重复序列间区（Inter—simple sequence repeat，ISSR）
十三 逆转录PCR（Reverse transcription PCR．RT．PCR）
十四 差异显示逆转录PCR（Differential display reverse transcription PCR，DDRT-PCR）
十五 表达序列标签（Expressed sequence tags，EST）
十六 单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP）
第三节 新型的DNA指纹技术
一 抗病基因同源序列（Resistance gene analogs，RGAs）
二 随机微卫星扩增多态DNA（Random microsatellite amplify polymorphic DNA，RMAPD）
三 相关序列扩增多态性（Sequence related amplifiedpolymorphism，SRAP）
四 靶位区域扩增多态性（Target region amplified polymorphism，TRAP）
第三章 DNA指纹图谱数据分析
第一节 遗传标记的分类
一 质量性状
二 数量性状
第二节 遗传标记研究方法
一 遗传相似分析
二 遗传标记间相关性
第四章 SSR与水稻遗传多样性研究
第一节 植物遗传多样性研究
一 植物遗传多样性研究意义
二 植物遗传多样性研究手段
三 遗传多样性分析方法
第二节 SSR标记对稻属AA染色体组个种间多样性与亲缘关系分析
一 稻属的分类及种质资源
二 SSR与水稻遗传多样性研究进展
三 稻属AA染色体组8个种间多样性与亲缘关系分析
第三节 SSR标记对粳稻遗传多样性的研究
一 研究背景及意义
二 SSR与粳稻遗传多样性
第四节 籼稻品种的遗传多样性分析
一 籼稻遗传多样性研究背景
二 SSR与籼稻遗传多样性
第五节 SSR标记对稽稻分类地位的研究
一 研究背景及意义
二 稽稻分类地位的研究
第五章 DNA分子标记与常规育种技术相结合快速聚合抗性基因
第一节 水稻主要病虫害抗性遗传与多抗育种发展现状
一 稻瘟病抗性遗传与育种
二 白叶枯病抗性遗传与育种
三 稻飞虱抗性遗传与育种
四 多抗育种发展现状
第二节 利用CAPS标记和花药培养相结合的方法快速聚合水稻抗性基因
一 xa-5基因的分子标记与精细定位和克隆
二 xa-5分子标记与花药培养相结合培育优质多抗水稻
三 讨论
参考文献
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