集刊《日本学研究》是为了促进中国日本学研究的发展，1991年由北京日本学研究中心（中国国家教育部与日本国国际交流基金共同创建的研究生院级的日本学教学与研究机构）创办的学术刊物。创刊至今，在主编及全体编辑人员的共同努力下，作为年刊已经连续出版了27辑，刊载了国内外从事日本学研究人员的有关日本的语言、文学、社会、文化、经济、教育等方面的学术研究论文近800篇，受到了国内外日本学研究界的广泛好评，为中国的日本学研究领域提供了一个公开的学术交流平台。
2018年，为了满足我国日本学研究以及区域与国别研究的迫切需要，《日本学研究》进行了改版，改为由“北京日本学研究中心”与“教育部区域与国别研究基地——日本研究中心”共同主办，同时也由每年一辑增加为每年两辑。常设“特别约稿”、“日语语言与教育”、“日本文学与文化”、“日本社会与经济”、“区域与国别研究”、“热点问题研究”、“海外日本学研究”、“书评”等栏目。
2021年该集刊入选CSSCI。
主编郭连友，北京日本学研究中心主任，教授，博士生导师，文学博士。研究领域为日本思想史、日本文化史、中日文化交流史。代表性学术成果有《吉田松阴与近代中国》、《近世中日思想交流论集》（编著）、《日本艺术文化丛书》（全十册）（编著）等。
海外日本学研究专栏 本专栏主编说明 郭连友 何谓“日本”，何以“国际” ——“国际日本学”的机制建设及反思 贺平 数字人文学与日本研究 [加]杨晓捷 韩国的日本研究 [韩]李康民 著，党蓓蓓 译 韩国的日本研究动向与“脱殖民主义” ——以日本学与日本思想为中心 [韩]全成坤 文学与国家主义——解构平安朝 [澳]倪锦丹 欧美的日本学研究与问题 [日]寺泽行忠 著，魏正 译 法国日本研究的现状与动向 [法]堀内·安妮可·美都(Annick Horiuchi) 著，张龙妹 译 荷兰的日本研究 [荷]辛西娅·维亚勒 著，刘玥扬 译 俄罗斯日本研究的历史与现状 [俄]叶卡捷琳娜·什马耶夫斯卡娅 著，范晓雅 译 日本语言与教育 “-主義”与“-イズム”的竞争 ——以日本大正时期新词词典『新しい言葉の字引』两版比较为中心 邓牧 日本文学与文化 上田秋成的《故乡》与中国文学 ——知命保身思想的渊源及安分意识 岳远坤 文化记忆视域下的柳田国男民俗学 孙敏 心身关系论在近代日本汉方医学哲学中的中西汇通 赵熠玮 清初福建文人与琉·日文人的交流——以王登瀛为中心 季龙飞 日本社会与经济 日语能力对中国城市高学历人群工资收入的影响研究 ——基于Global Career Survey 2012调查上海数据的实证分析 李飞菲 周维宏 书评 评《从国学到日本学——剑桥大学图书馆与现代日本研究的历程》 龚颖 “内部中”与“边界上”的人 ——评苅部直《丸山真男——一位自由主义者的肖像》 魏正 读藤田正胜著《日本文化关键词》 王蕊 附录 亚洲、大洋洲日本研究机构、学会 美国、加拿大日本研究机构、学会 欧洲日本研究机构、学会 《日本学研究》征稿说明 《日本学研究》稿件撰写体例要求
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